La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est une maladie neurodégénérative incurable caractérisée par la perte progressive des motoneurones et une atrophie du muscle squelettique, conduisant à une paralysie puis au décès dans les 2 à 5 ans suivant le diagnostic. Si la majorité des recherches se sont historiquement concentrées sur les motoneurones, des données récentes montrent que le muscle squelettique constitue un acteur à part entière de la physiopathologie de la SLA, contribuant aux altérations fonctionnelles et au dialogue pathologique avec les motoneurones. Les mécanismes moléculaires intrinsèques au muscle restent toutefois encore largement méconnus. Notre projet vise à mieux comprendre ces mécanismes en s’appuyant sur des modèles musculaires humains afin d’identifier des signatures moléculaires spécifiques de la SLA grâce à une approche intégrée combinant analyses transcriptomiques, épigénétiques et fonctionnelles.

Dans ce contexte, le/la stagiaire participera à l’étude de l’impact de différents stress environnementaux (oxydatif, inflammatoire et mécanique) sur les cellules musculaires, afin de distinguer les réponses adaptatives des mécanismes délétères associés à la progression de la maladie. Ces travaux seront réalisés sur des modèles musculaires humains en culture 2D et en système 3D, plus proches des conditions physiologiques. Le stage permettra au/à la candidat(e) de mettre en œuvre un large éventail de techniques de biologie cellulaire, moléculaire et biochimique, notamment la culture et la différenciation de cellules musculaires, la stimulation électrique de myotubes, l’extraction d’ARN, l’analyse de l’expression génique par RT-qPCR ainsi que l’analyse de protéines par Western blot. Selon l’avancement du projet, le/la stagiaire pourra également être amené(e) à participer à l’analyse des données et à la caractérisation fonctionnelle des modèles musculaires.

Nous recherchons un(e) étudiant(e) de Master 2 motivé(e), curieux(se) et rigoureux(se), possédant de solides bases en biologie cellulaire, biologie moléculaire et biochimie. Le stage se déroulera au sein de l’équipe Physiopathologie du système neuromusculaire de l’Institut Cochin, plus particulièrement dans le sous-groupe ABRI, composé d’une doctorante, d’une ingénieure de recherche CNRS-HDR et de l’encadrante, maîtresse de conférences à l’Université Paris Cité. Le/la stagiaire évoluera dans un environnement scientifique dynamique et multidisciplinaire, bénéficiant de l’accès aux plateformes technologiques de l’Institut Cochin (imagerie, transcriptomique, bioinformatique, cytométrie, etc.), favorisant l’acquisition de compétences techniques de haut niveau et une formation à la recherche par la recherche.

 

Dernières Publications  :

 –  Shaping 3D minimal model tissues with mechanical constraints to orchestrate muscle differentiation. Nagle I, van der Spek L, Gesenhues P, Savy T, Réa L, Richert A, Receveur M, Delort F, Batonnet-Pichon S, Wilhelm C, Luciani N, Reffay M. Commun Biol. 2025 Nov 28;8(1):1853. doi: 10.1038/s42003-025-09252-9.

– R405W Desmin Knock-In Mice Highlight Alterations of Mitochondria, Protein Quality Control and Myofibrils in Myofibrillar Myopathy. Batonnet-Pichon S, Delort F, Lilienbaum A, Berwanger C, Schultheis D, Schlötzer-Schrehardt U, Schmidt A, Uebe S, Baiche Y, Eisenack TJ, Trentini DB, Mallek M, Mill L, Ferreiro A, Eberhard B, Lücke T, Krüger M, Thiel C, Schröder R, Clemen CS.J Cachexia Sarcopenia Muscle. 2025 Dec;16(6):e70094. doi: 10.1002/jcsm.70094.

– The importance of intermediate filaments in the shape maintenance of myoblast model tissues. Nagle I, Delort F, Hénon S, Wilhelm C, Batonnet-Pichon S, Reffay M.Elife. 2022 Dec 1;11:e76409. doi: 10.7554/eLife.76409.

– Desmin Modulates Muscle Cell Adhesion and Migration.

Hakibilen C, Delort F, Daher MT, Joanne P, Cabet E, Cardoso O, Bourgois-Rocha F, Tian C, Rivas E, Madruga M, Ferreiro A, Lilienbaum A, Vicart P, Agbulut O, Hénon S, Batonnet-Pichon S.Front Cell Dev Biol. 2022 Mar 8;10:783724. doi: 10.3389/fcell.2022.783724. eCollection 2022.

– Alterations of redox dynamics and desmin post-translational modifications in skeletal muscle models of desminopathies. Delort F, Segard BD, Hakibilen C, Bourgois-Rocha F, Cabet E, Vicart P, Huang ME, Clary G, Lilienbaum A, Agbulut O, Batonnet-Pichon S.Exp Cell Res. 2019 Oct 15;383(2):111539. doi: 10.1016/j.yexcr.2019.111539. Epub 2019 Jul 29.

Perspective d’une thèse à définir