Biologie intégrative et biologie de synthèse


Responsables

Annick Mejean – Aurore Vidy

Objectifs

  • Appréhender les apports récents de la génomique et des outils d’analyse multi-échelle permettant l’étude de microorganismes (virus, bactéries, microorganismes eucaryotes) en interaction avec d’autres systèmes biologiques, afin de mieux comprendre et contrôler les conséquences de ces interactions.
  • Comprendre les approches permettant la manipulation efficace des génomes des microorganismes afin de construire des systèmes biologiques synthétiques possédant de nouvelles fonctions ou permettant la bioproduction de molécules d’intérêt.

Cours Magistraux 16h

  • Utilisation des méthodes d’analyse ciblée et à grande échelle pour réaliser des études de microbiologie ou virologie intégrative
  • Régulations multi échelle, physiologie intégrative et biologie des systèmes
  • Biologie de synthèse et stratégies de bioproduction chez des microorganismes procaryotes, eucaryotes et des virus
  • Présentation des défis iGem

Travaux Dirigés 8h

Microprojet de microbiologie de synthèse et/ou intégrative (bactériologie, microbiologie eucaryote ou virologie)

  • Travail personnel en groupe : analyse critique du projet, choix libre d’une approche originale de la thématique, méthodologie, bibliographie, réflexion sur les perspectives
  • Présentation orale, avec support (diaporama), de l’analyse du projet étudié (état de l’art, objectifs, mise en œuvre, conclusion, applications possibles du projet)

Compétences visées

  • Acquérir les grands principes de manipulation des génomes viraux, bactériens ou d’autres microorganismes à des fins :
    • de production de protéines
    • d’obtention de nouvelles fonctions métaboliques
    • d’applications vaccinales, thérapeutiques ou à visée oncolytique
  • Notions d’analyses multi-échelle de systèmes d’infection/prolifération de microorganismes (virus, bactéries, microorganismes eucaryotes)