Biologie computationnelle


Responsable

Anne Vanet

Objectifs

Aborder la découverte du traitement des données en masse.

Cours Magistraux 10h

  • Découverte du système d’exploitation Unix/Linux
  • Base d’algorithmique
  • Découverte de quelques outils mathématiques nécessaires pour l’exploration des données en masses
  • Bases de programmation

Travaux Pratiques 22h

  • Analyse de données générées à haut débit et libre d’utilisation dans les bases de données internationales.
  • Le système d’exploitation de type Unix et les langages python/perl/R seront utilisés pour les analyses sur ordinateur, mais les novices seront accompagnés pour y être initiés.

Compétences visées

  • Acquérir des compétences et des connaissances théoriques et pratiques en bio-informatique
  • Déterminer une stratégie de bio-informatique pour résoudre un problème biologique
  • Aptitude à interpréter les résultats d’une analyse bio-informatique
  • Capacité à utiliser des Systèmes d’information biologique
  • Maîtriser les concepts théoriques et méthodologiques de la bio-informatique pour l’analyse et la comparaison de séquences biologiques
  • Mobiliser des concepts fondamentaux de génétique, biologie moléculaire,… pour traiter une problématique en big data
  • Mobiliser les concepts et les outils des mathématiques, et de l’informatique dans le cadre des problématiques des sciences du vivant.
  • Identifier, choisir et appliquer une combinaison d’outils analytiques adaptés à l’analyse des données génomiques
  • Interpréter les données expérimentales